README.md

@@ -118,7 +118,7 @@ cd frontend
 pnpm test
 ```
 
-当前回归基线为后端 107 项测试、前端 29 项测试，且 TypeScript 类型检查和生产构建通过。测试数量会随功能增长，以本地实际输出和 CI 为准。
+当前回归基线为后端 116 项测试、前端 29 项测试，且 TypeScript 类型检查和生产构建通过。测试数量会随功能增长，以本地实际输出和 CI 为准。
 
 构建产物位于 `frontend/dist`，该目录不提交到 Git。
 

backend/README.md

@@ -23,7 +23,7 @@ uv run uvicorn app.main:app --reload --host 127.0.0.1 --port 8000
 uv run pytest
 ```
 
-当前基线为 107 项测试通过。Provider API Key 可通过前端设置页写入，也可用 `OPENAI_API_KEY`、`DEEPSEEK_API_KEY` 或 `AINOTE_CREDENTIAL_<ID>` 注入；不要把真实密钥写入仓库。`plugin.*` 是 Plugin Settings 的保留凭据命名空间，通用 Provider 凭据接口不能读写。
+当前基线为 116 项测试通过。Provider API Key 可通过前端设置页写入，也可用 `OPENAI_API_KEY`、`DEEPSEEK_API_KEY` 或 `AINOTE_CREDENTIAL_<ID>` 注入；不要把真实密钥写入仓库。`plugin.*` 是 Plugin Settings 的保留凭据命名空间，通用 Provider 凭据接口不能读写。
 
 团队接口清单见 `../docs/contracts/后端接口契约-开发版.md`，机器可读契约以运行时的 `/openapi.json` 为准。
 

backend/app/agent/tools.py

@@ -11,6 +11,7 @@ from jsonschema import Draft202012Validator
 from jsonschema.exceptions import ValidationError as JsonSchemaValidationError
 
 from app.contracts import ToolCall, ToolDefinition, ToolResult
+from app.schema_security import reject_external_schema_references
 
 ToolExecutor = Callable[[BaseModel, "ToolExecutionContext"], Any | Awaitable[Any]]
 
@@ -54,6 +55,7 @@ class ToolRegistry:
         arguments_model: type[BaseModel],
         executor: ToolExecutor,
     ) -> None:
+        reject_external_schema_references(definition.parameters)
         with self._lock:
             if definition.name in self._tools:
                 raise ValueError(f"Tool already registered: {definition.name}")

backend/app/extensions/contributions.py

@@ -3,6 +3,7 @@
 from __future__ import annotations
 
 import asyncio
+import hashlib
 import inspect
 import json
 import math
@@ -17,7 +18,7 @@ from typing import Any, Awaitable, Callable, Literal
 
 from jsonschema import Draft202012Validator
 from jsonschema.exceptions import SchemaError, ValidationError as JsonSchemaValidationError
-from pydantic import BaseModel, ConfigDict, Field
+from pydantic import BaseModel, ConfigDict, Field, model_validator
 
 from app.config import get_settings
 from app.contracts import (
@@ -34,6 +35,10 @@ from app.contracts import (
 )
 from app.extensions.errors import ExtensionError
 from app.providers.credentials import CredentialStoreError, EncryptedCredentialStore
+from app.schema_security import (
+    SchemaReferenceError,
+    reject_external_schema_references,
+)
 
 _CONTRIBUTION_ID = re.compile(r"^[a-z0-9][a-z0-9._-]*$")
 _SETTING_KEY = re.compile(r"^[a-z][a-z0-9._-]{0,127}$")
@@ -74,9 +79,16 @@ class PluginCommandSpec(BaseModel):
     )
     permission: str | None = None
     secrets: list[str] = Field(default_factory=list)
-    handler: Literal["echo", "uppercase_selection"]
+    handler: Literal["echo", "uppercase_selection"] | None = None
+    mcp_tool: str | None = None
     timeout_seconds: int = Field(default=30, ge=1, le=120)
 
+    @model_validator(mode="after")
+    def validate_execution_target(self) -> "PluginCommandSpec":
+        if (self.handler is None) == (self.mcp_tool is None):
+            raise ValueError("Command must declare exactly one handler or mcp_tool target.")
+        return self
+
 
 CommandExecutor = Callable[
     [dict[str, Any], dict[str, Any]],
@@ -689,11 +701,13 @@ def validate_command_spec(plugin_id: str, spec: PluginCommandSpec) -> None:
     if spec.parameters.get("type", "object") != "object":
         raise ExtensionError("PLUGIN_COMMAND_INVALID", "Command parameters must be an object schema.")
     try:
+        reject_external_schema_references(spec.parameters)
         Draft202012Validator.check_schema(spec.parameters)
-    except SchemaError as exc:
+    except (SchemaReferenceError, SchemaError) as exc:
+        message = exc.message if isinstance(exc, SchemaError) else str(exc)
         raise ExtensionError(
             "PLUGIN_COMMAND_INVALID",
-            f"Plugin command parameters contain invalid JSON Schema: {exc.message}",
+            f"Plugin command parameters contain invalid JSON Schema: {message}",
         ) from exc
 
 
@@ -746,7 +760,8 @@ def _secret_field(
 
 
 def _secret_reference(plugin_id: str, key: str) -> str:
-    return f"plugin.{plugin_id}.{key}"
+    digest = hashlib.sha256(f"{plugin_id}\0{key}".encode("utf-8")).hexdigest()
+    return f"plugin.{digest}"
 
 
 def _settings_schema_error(plugin_id: str, message: str) -> ExtensionError:

backend/app/extensions/mcp.py

@@ -29,6 +29,10 @@ from app.contracts import (
     PluginHostStatus,
     ToolDefinition,
 )
+from app.schema_security import (
+    SchemaReferenceError,
+    reject_external_schema_references,
+)
 
 MCP_PROTOCOL_VERSION = "2025-11-25"
 SUPPORTED_PROTOCOL_VERSIONS = {
@@ -676,11 +680,13 @@ class McpBridge:
                 f"MCP tool inputSchema must be an object schema: {remote_name}",
             )
         try:
+            reject_external_schema_references(schema)
             Draft202012Validator.check_schema(schema)
-        except SchemaError as exc:
+        except (SchemaReferenceError, SchemaError) as exc:
+            message = exc.message if isinstance(exc, SchemaError) else str(exc)
             raise McpBridgeError(
                 "MCP_TOOL_SCHEMA_INVALID",
-                f"Invalid MCP tool schema for {remote_name}: {exc.message}",
+                f"Invalid MCP tool schema for {remote_name}: {message}",
             ) from exc
         metadata = raw.get("_meta")
         permission = (

backend/app/extensions/runtime.py

@@ -5,13 +5,14 @@ import threading
 from dataclasses import dataclass
 from pathlib import Path
 from typing import Any, Literal
+from uuid import uuid4
 
 import yaml
 from jsonschema import Draft202012Validator
 from jsonschema.exceptions import SchemaError
 from pydantic import BaseModel, ConfigDict, Field, ValidationError, create_model
 
-from app.agent.tools import ToolExecutionContext, ToolRegistry
+from app.agent.tools import ToolExecutionContext, ToolExecutionError, ToolRegistry
 from app.agent.permissions import KNOWN_PERMISSIONS
 from app.contracts import (
     ModelCapability,
@@ -45,6 +46,10 @@ from app.extensions.contributions import (
 from app.extensions.errors import ExtensionError
 from app.extensions.mcp import McpBridge, McpBridgeError, McpDiscoveredTool
 from app.providers.credentials import EncryptedCredentialStore
+from app.schema_security import (
+    SchemaReferenceError,
+    reject_external_schema_references,
+)
 
 _EXTENSION_ID = re.compile(r"^[a-z0-9][a-z0-9._-]*$")
 
@@ -410,6 +415,22 @@ class PluginRuntime:
                     "Commands using Secret settings require the secrets.use permission.",
                     details={"command_id": spec.command_id},
                 )
+            if spec.mcp_tool is not None:
+                _validate_id("MCP command target", spec.mcp_tool)
+                if manifest.backend.type != "mcp" or not spec.mcp_tool.startswith(
+                    f"{manifest.plugin_id}."
+                ):
+                    raise ExtensionError(
+                        "PLUGIN_COMMAND_INVALID",
+                        "MCP Command target must use the current Plugin namespace.",
+                        details={"command_id": spec.command_id},
+                    )
+                if spec.mcp_tool in manifest.contributes.tools:
+                    raise ExtensionError(
+                        "PLUGIN_COMMAND_INVALID",
+                        "MCP Command target cannot also be exposed as an Agent Tool.",
+                        details={"command_id": spec.command_id},
+                    )
 
         record = _PluginRecord(
             plugin=Plugin(
@@ -492,14 +513,21 @@ class PluginRuntime:
                 discovered = self._start_mcp(record)
                 actual = {item.definition.name for item in discovered}
                 declared = set(declared_tools)
-                if actual != declared:
+                command_targets = {
+                    spec.mcp_tool for spec in record.commands if spec.mcp_tool is not None
+                }
+                expected = declared | command_targets
+                if actual != expected:
                     raise ExtensionError(
                         "PLUGIN_CONTRIBUTION_INVALID",
-                        "Discovered MCP tools must exactly match Plugin contributions.",
+                        "Discovered MCP tools must exactly match Tool and Command targets.",
-                        details={"declared": sorted(declared), "actual": sorted(actual)},
+                        details={"declared": sorted(expected), "actual": sorted(actual)},
                     )
                 for item in discovered:
-                    self._register_mcp_tool(record, item)
+                    if item.definition.name in declared:
+                        self._register_mcp_tool(record, item)
+                    else:
+                        record.mcp_remote_names[item.definition.name] = item.remote_name
             else:
                 for spec in record.tools:
                     arguments_model = _arguments_model(spec)
@@ -549,6 +577,7 @@ class PluginRuntime:
                         if _record.settings_definition is not None
                         else {}
                     )
+
                     def resolve_secret(key: str) -> str | None:
                         if key not in _spec.secrets:
                             raise ExtensionError(
@@ -569,11 +598,62 @@ class PluginRuntime:
                             )
                         if _record.settings_definition is None:
                             return None
-                        return self.settings.resolve_secret(
+                        value = self.settings.resolve_secret(
                             _record.plugin.manifest.plugin_id,
                             _record.settings_definition,
                             key,
                         )
+                        field = next(
+                            item
+                            for item in _record.settings_definition.fields
+                            if item.key == key
+                        )
+                        if field.required and value is None:
+                            raise ExtensionError(
+                                "PLUGIN_SECRET_REQUIRED",
+                                "A required Plugin Secret has not been configured.",
+                                status_code=409,
+                                details={"command_id": _spec.command_id, "key": key},
+                            )
+                        return value
+
+                    if _spec.mcp_tool is not None:
+                        remote_name = _record.mcp_remote_names[_spec.mcp_tool]
+                        secret_values = {
+                            key: value
+                            for key in _spec.secrets
+                            if (value := resolve_secret(key)) is not None
+                        }
+                        try:
+                            effect = await self.mcp.call_tool(
+                                _record.plugin.manifest.plugin_id,
+                                remote_name,
+                                {
+                                    "_notesagent": {
+                                        "command_id": _spec.command_id,
+                                        "arguments": arguments,
+                                        "context": context,
+                                        "secrets": secret_values,
+                                    }
+                                },
+                                request_id=f"command:{uuid4().hex}",
+                            )
+                        except ToolExecutionError as exc:
+                            raise ExtensionError(
+                                exc.code,
+                                "MCP Command target execution failed.",
+                                status_code=502,
+                                details={"command_id": _spec.command_id},
+                            ) from exc
+                        try:
+                            return PluginCommandEffect.model_validate(effect)
+                        except ValidationError as exc:
+                            raise ExtensionError(
+                                "PLUGIN_COMMAND_RESULT_INVALID",
+                                "MCP Command target returned an invalid effect.",
+                                status_code=502,
+                                details={"command_id": _spec.command_id},
+                            ) from exc
 
                     return await self.host.execute_command(
                         _spec.handler,
@@ -963,11 +1043,13 @@ def _arguments_model_from_schema(
 def _validate_tool_schema(spec: DeclarativeToolSpec) -> None:
     schema = spec.parameters or {"type": "object", "properties": {}}
     try:
+        reject_external_schema_references(schema)
         Draft202012Validator.check_schema(schema)
-    except SchemaError as exc:
+    except (SchemaReferenceError, SchemaError) as exc:
+        message = exc.message if isinstance(exc, SchemaError) else str(exc)
         raise ExtensionError(
             "PLUGIN_TOOL_SCHEMA_INVALID",
-            f"Invalid JSON Schema for tool {spec.name}: {exc.message}",
+            f"Invalid JSON Schema for tool {spec.name}: {message}",
             details={"tool": spec.name},
         ) from exc
     if schema.get("type", "object") != "object" or not isinstance(

backend/app/schema_security.py

@@ -0,0 +1,70 @@
+"""共享 JSON Schema 安全约束。"""
+
+from __future__ import annotations
+
+from typing import Any
+from urllib.parse import unquote
+
+
+class SchemaReferenceError(ValueError):
+    """Schema 引用不符合宿主的离线、文档内解析约束。"""
+
+
+class ExternalSchemaReferenceError(SchemaReferenceError):
+    def __init__(self, keyword: str, reference: Any) -> None:
+        super().__init__(f"External JSON Schema reference is not allowed: {reference!r}")
+        self.keyword = keyword
+        self.reference = reference
+
+
+class UnresolvableLocalSchemaReferenceError(SchemaReferenceError):
+    def __init__(self, reference: str) -> None:
+        super().__init__(f"Local JSON Schema reference cannot be resolved: {reference!r}")
+        self.reference = reference
+
+
+def reject_external_schema_references(schema: Any) -> None:
+    """只允许可解析的文档内 Fragment，禁止文件和网络检索。"""
+
+    pending = [schema]
+    local_references: list[str] = []
+    anchors: set[str] = set()
+    while pending:
+        value = pending.pop()
+        if isinstance(value, dict):
+            for key, child in value.items():
+                if key in {"$ref", "$dynamicRef"}:
+                    if not isinstance(child, str) or not child.startswith("#"):
+                        raise ExternalSchemaReferenceError(key, child)
+                    local_references.append(child)
+                elif key in {"$anchor", "$dynamicAnchor"} and isinstance(child, str):
+                    anchors.add(child)
+                pending.append(child)
+        elif isinstance(value, list):
+            pending.extend(value)
+
+    for reference in local_references:
+        if not _local_reference_exists(schema, reference, anchors):
+            raise UnresolvableLocalSchemaReferenceError(reference)
+
+
+def _local_reference_exists(schema: Any, reference: str, anchors: set[str]) -> bool:
+    fragment = unquote(reference[1:])
+    if not fragment:
+        return True
+    if not fragment.startswith("/"):
+        return fragment in anchors
+
+    current = schema
+    for encoded_segment in fragment[1:].split("/"):
+        segment = encoded_segment.replace("~1", "/").replace("~0", "~")
+        if isinstance(current, dict) and segment in current:
+            current = current[segment]
+        elif isinstance(current, list) and segment.isdecimal():
+            index = int(segment)
+            if index >= len(current):
+                return False
+            current = current[index]
+        else:
+            return False
+    return True

backend/extensions/fixtures/mcp-echo/commands.yaml

@@ -0,0 +1,20 @@
+commands:
+  - command_id: mcp-fixture.notify
+    title: MCP 通知
+    description: 通过隔离 MCP Host 返回宿主白名单通知 effect。
+    icon: bolt
+    locations:
+      - command_palette
+    when:
+      - editor.has_selection
+    context:
+      - selection
+    secrets:
+      - api_key
+    mcp_tool: mcp-fixture.command
+    parameters:
+      type: object
+      properties:
+        message:
+          type: string
+      additionalProperties: false

backend/extensions/fixtures/mcp-echo/plugin.yaml

@@ -1,9 +1,10 @@
 id: mcp-fixture
 name: MCP Fixture
 version: 1.0.0
-description: 阶段 C 离线联调 Fixture，覆盖 MCP Tool 生命周期与错误边界。
+description: 阶段 C/D 离线联调 Fixture，覆盖 MCP Tool、Command 与错误边界。
 permissions:
   - notes.read
+  - secrets.use
 contributes:
   tools:
     - mcp-fixture.echo
@@ -12,6 +13,10 @@ contributes:
     - mcp-fixture.large
     - mcp-fixture.environment
     - mcp-fixture.exit
+  commands:
+    - mcp-fixture.notify
+  settings_sections:
+    - mcp-fixture.general
 backend:
   type: mcp
   transport: stdio

backend/extensions/fixtures/mcp-echo/server.py

@@ -54,6 +54,11 @@ TOOLS = {
     "large": tool("large", "Return a result larger than the host limit."),
     "environment": tool("environment", "Report whether host secrets leaked into the process."),
     "exit": tool("exit", "Terminate the fixture process."),
+    "command": tool(
+        "command",
+        "Execute a NotesAgent Plugin Command envelope.",
+        {"_notesagent": {"type": "object"}},
+    ),
 }
 # suffix 是可选字段，用于验证 Host 不会把缺省值擅自补成 null。
 TOOLS["echo"]["inputSchema"]["required"] = ["text"]
@@ -62,6 +67,28 @@ TOOLS["echo"]["inputSchema"]["required"] = ["text"]
 def call_tool(request_id: int, params: dict[str, Any]) -> None:
     name = params.get("name")
     arguments = params.get("arguments") or {}
+    if name == "command":
+        envelope = arguments.get("_notesagent") or {}
+        command_arguments = envelope.get("arguments") or {}
+        context = envelope.get("context") or {}
+        secrets = envelope.get("secrets") or {}
+        message = command_arguments.get("message") or context.get("selection") or ""
+        respond(
+            request_id,
+            {
+                "content": [{"type": "text", "text": "command completed"}],
+                "structuredContent": {
+                    "type": "notification",
+                    "payload": {
+                        "level": "success",
+                        "message": str(message),
+                        "secret_configured": isinstance(secrets.get("api_key"), str),
+                    },
+                },
+                "isError": False,
+            },
+        )
+        return
     if name == "echo":
         text = str(arguments.get("text", ""))
         structured_content = {"echo": text}
@@ -183,7 +210,14 @@ def main() -> None:
             elif params.get("cursor") == "page-2":
                 respond(
                     request_id,
-                    {"tools": [TOOLS["large"], TOOLS["environment"], TOOLS["exit"]]},
+                    {
+                        "tools": [
+                            TOOLS["large"],
+                            TOOLS["environment"],
+                            TOOLS["exit"],
+                            TOOLS["command"],
+                        ]
+                    },
                 )
             else:
                 respond(

backend/extensions/fixtures/mcp-echo/settings.yaml

@@ -0,0 +1,7 @@
+section_id: mcp-fixture.general
+schema_version: 1
+fields:
+  - key: api_key
+    label: Fixture API Key
+    type: secret
+    required: true

backend/tests/test_extension_core.py

@@ -11,6 +11,7 @@ from app.container import build_container
 from app.contracts import (
     AgentRunCreateRequest,
     AgentRunStatus,
+    PluginCommandContext,
     SkillStatus,
     ToolCall,
 )
@@ -33,7 +34,7 @@ def mcp_container():
     container = build_container()
     installed = container.plugins.install(MCP_FIXTURE)
     assert installed.status == "permission_required"
-    container.plugins.set_permissions("mcp-fixture", ["notes.read"])
+    container.plugins.set_permissions("mcp-fixture", ["notes.read", "secrets.use"])
     try:
         yield container
     finally:
@@ -349,7 +350,7 @@ def test_mcp_stdio_host_discovers_namespaced_tools_and_maps_results(
             ToolExecutionContext(run_id="run_mcp_fixture"),
         )
 
-        assert status.tools_count == 6
+        assert status.tools_count == 7
         assert status.protocol_version == "2025-11-25"
         assert status.server_name == "notesagent-mcp-fixture"
         assert definition.permission == "notes.read"
@@ -396,6 +397,46 @@ def test_mcp_stdio_host_discovers_namespaced_tools_and_maps_results(
     run(scenario())
 
 
+def test_mcp_command_target_receives_scoped_context_and_declared_secret(
+    mcp_container,
+) -> None:
+    async def scenario() -> None:
+        mcp_container.plugins.enable("mcp-fixture")
+
+        assert not mcp_container.tools.contains("mcp-fixture.command")
+        with pytest.raises(ExtensionError) as missing:
+            await mcp_container.plugins.execute_command(
+                "mcp-fixture.notify",
+                {},
+                PluginCommandContext(selection="来自选区"),
+            )
+        assert missing.value.code == "PLUGIN_SECRET_REQUIRED"
+
+        mcp_container.plugins.put_setting_secret(
+            "mcp-fixture", "api_key", "mcp-command-secret"
+        )
+        result = await mcp_container.plugins.execute_command(
+            "mcp-fixture.notify",
+            {},
+            PluginCommandContext(
+                note_id="must-not-enter-envelope",
+                selection="来自选区",
+            ),
+        )
+
+        assert result.effect.type == "notification"
+        assert result.effect.payload == {
+            "level": "success",
+            "message": "来自选区",
+            "secret_configured": True,
+        }
+        assert "mcp-command-secret" not in repr(
+            mcp_container.plugins.commands.audit_events()
+        )
+
+    run(scenario())
+
+
 def test_agent_calls_mcp_tool_through_registry_and_writes_trace(mcp_container) -> None:
     async def scenario() -> None:
         mcp_container.plugins.enable("mcp-fixture")
@@ -531,7 +572,7 @@ def test_production_rejects_unsandboxed_mcp_host(monkeypatch) -> None:
     container = build_container()
     installed = container.plugins.install(MCP_FIXTURE)
     assert installed.status == "permission_required"
-    container.plugins.set_permissions("mcp-fixture", ["notes.read"])
+    container.plugins.set_permissions("mcp-fixture", ["notes.read", "secrets.use"])
     try:
         with pytest.raises(ExtensionError) as exc:
             container.plugins.enable("mcp-fixture")
@@ -565,7 +606,7 @@ def test_mcp_abnormal_exit_unregisters_tools_and_restart_recovers(mcp_container)
 
         restarted = mcp_container.plugins.restart_host("mcp-fixture")
         assert restarted.status == "ready"
-        assert restarted.tools_count == 6
+        assert restarted.tools_count == 7
         assert mcp_container.tools.contains("mcp-fixture.echo")
 
     run(scenario())

backend/tests/test_plugin_contributions.py

@@ -13,6 +13,7 @@ from app.contracts import (
     PluginSettingType,
 )
 from app.extensions import ExtensionError, PluginRuntime
+from app.extensions.contributions import _secret_reference
 from app.extensions.runtime import DeclarativePluginHost
 
 TEXT_TOOLS = BACKEND_DIR / "extensions" / "plugins" / "text-tools"
@@ -260,24 +261,39 @@ def test_secret_roundtrip_never_enters_plain_settings_storage() -> None:
     assert "api_key" not in schema.values
     assert plaintext not in settings_path.read_text(encoding="utf-8")
     assert plaintext not in credentials_path.read_text(encoding="utf-8")
-    assert container.credentials.resolve("plugin.text-tools.api_key") == plaintext
+    stored_settings = json.loads(settings_path.read_text(encoding="utf-8"))
+    reference = stored_settings["text-tools"]["secret_refs"]["api_key"]
+    assert reference.startswith("plugin.")
+    assert len(reference) == 71
+    assert "text-tools" not in reference and "api_key" not in reference
+    assert container.credentials.resolve(reference) == plaintext
 
     deleted = container.plugins.delete_setting_secret("text-tools", "api_key")
     assert deleted.configured is False
-    assert container.credentials.resolve("plugin.text-tools.api_key") is None
+    assert container.credentials.resolve(reference) is None
 
 
 def test_uninstall_removes_plugin_settings_and_secret_namespace() -> None:
     container = build_container()
     container.plugins.update_settings("text-tools", 1, {"result_limit": 12})
     container.plugins.put_setting_secret("text-tools", "api_key", "temporary")
+    settings_path = get_settings().data_dir / "plugins" / "settings.json"
+    reference = json.loads(settings_path.read_text(encoding="utf-8"))[
+        "text-tools"
+    ]["secret_refs"]["api_key"]
 
     container.plugins.uninstall("text-tools")
 
-    settings_path = get_settings().data_dir / "plugins" / "settings.json"
     stored = json.loads(settings_path.read_text(encoding="utf-8"))
     assert "text-tools" not in stored
-    assert container.credentials.resolve("plugin.text-tools.api_key") is None
+    assert container.credentials.resolve(reference) is None
+
+
+def test_plugin_secret_reference_has_fixed_credential_safe_length() -> None:
+    reference = _secret_reference("p" * 512, "k" * 128)
+
+    assert reference.startswith("plugin.")
+    assert len(reference) <= 128
 
 
 def test_invalid_command_and_settings_manifest_are_rejected(tmp_path: Path) -> None:
@@ -363,6 +379,42 @@ backend:
     assert exc.value.code == "EXTENSION_MANIFEST_INVALID"
 
 
+def test_external_command_schema_reference_is_rejected(tmp_path: Path) -> None:
+    package = tmp_path / "external-ref"
+    package.mkdir()
+    (package / "plugin.yaml").write_text(
+        """
+id: external-ref
+name: External Ref
+version: 1.0.0
+contributes:
+  commands: [external-ref.run]
+backend:
+  type: internal_rpc
+  transport: none
+""".strip(),
+        encoding="utf-8",
+    )
+    (package / "commands.yaml").write_text(
+        """
+commands:
+  - command_id: external-ref.run
+    title: External Ref
+    locations: [command_palette]
+    handler: echo
+    parameters:
+      $ref: file:///host/private-schema.json
+""".strip(),
+        encoding="utf-8",
+    )
+
+    with pytest.raises(ExtensionError) as exc:
+        PluginRuntime(ToolRegistry()).install(package)
+
+    assert exc.value.code == "PLUGIN_COMMAND_INVALID"
+    assert "External JSON Schema reference" in exc.value.message
+
+
 def test_settings_missing_and_secret_field_errors_are_stable() -> None:
     container = build_container()
 
@@ -394,4 +446,10 @@ def test_corrupted_plugin_settings_namespace_returns_stable_error() -> None:
         container.plugins.put_setting_secret("text-tools", "api_key", "must-not-orphan")
 
     assert secret_exc.value.code == "PLUGIN_STORAGE_ERROR"
-    assert container.credentials.resolve("plugin.text-tools.api_key") is None
+    credentials_path = get_settings().data_dir / "credentials" / "credentials.json"
+    credential_ids = (
+        json.loads(credentials_path.read_text(encoding="utf-8")).keys()
+        if credentials_path.exists()
+        else []
+    )
+    assert not any(item.startswith("plugin.") for item in credential_ids)

backend/tests/test_schema_security.py

@@ -0,0 +1,35 @@
+import pytest
+
+from app.schema_security import (
+    ExternalSchemaReferenceError,
+    UnresolvableLocalSchemaReferenceError,
+    reject_external_schema_references,
+)
+
+
+@pytest.mark.parametrize(
+    "schema",
+    [
+        {"$ref": "file:///host/private-schema.json"},
+        {"properties": {"value": {"$ref": "https://schema.invalid/value.json"}}},
+        {"allOf": [{"$dynamicRef": "https://schema.invalid/dynamic"}]},
+    ],
+)
+def test_external_json_schema_references_are_rejected(schema) -> None:
+    with pytest.raises(ExternalSchemaReferenceError):
+        reject_external_schema_references(schema)
+
+
+def test_local_json_schema_fragment_reference_is_allowed() -> None:
+    reject_external_schema_references(
+        {
+            "$defs": {"value": {"type": "string"}},
+            "properties": {"value": {"$ref": "#/$defs/value"}},
+        }
+    )
+
+
+@pytest.mark.parametrize("reference", ["#/$defs/missing", "#missing-anchor"])
+def test_unresolvable_local_schema_reference_is_rejected(reference: str) -> None:
+    with pytest.raises(UnresolvableLocalSchemaReferenceError):
+        reject_external_schema_references({"type": "object", "$ref": reference})

docs/architecture/AI笔记软件技术栈说明-团队版-v2.3.md

@@ -2329,7 +2329,7 @@ Markdown Workspace
 
 第一阶段 Plugin Runtime 已完成安装、启用、停用、权限和声明式 Tool 注册，建立 Skill 调用 Plugin Tool 的基础链路。Command、Settings 和 MCP 执行不计入第一阶段完成项。
 
-截至 2026-09-02，上述第一阶段后端链路和 Web 联调前端均已完成；第二阶段前置的 Workspace 去 Mock 联调、Agent Trace 持久化/恢复接口、stdio MCP Bridge / Plugin Host 以及 Plugin Command/Settings 后端 Contract 也已完成。当前验证基线为后端 107 项测试、前端 29 项测试、TypeScript 类型检查及生产构建通过。向量链路当前使用 `HashEmbeddingProvider` 验证工程正确性，真实 Embedding 召回质量不属于该测试结论。
+截至 2026-09-02，上述第一阶段后端链路和 Web 联调前端均已完成；第二阶段前置的 Workspace 去 Mock 联调、Agent Trace 持久化/恢复接口、stdio MCP Bridge / Plugin Host 以及 Plugin Command/Settings 后端 Contract 也已完成。当前验证基线为后端 116 项测试、前端 29 项测试、TypeScript 类型检查及生产构建通过。向量链路当前使用 `HashEmbeddingProvider` 验证工程正确性，真实 Embedding 召回质量不属于该测试结论。
 
 第二阶段在既有 Contract 上接入：
 

docs/contracts/后端接口契约-开发版.md

@@ -176,7 +176,7 @@ RunCancelled
 
 ## 当前实现状态
 
-更新至 2026-09-02：后端 107 项回归测试通过；第二阶段 Plugin Command 与 Plugin Settings/Secret 接口已实现，详细 DTO 和边界见《第二阶段接口契约-开发版》第 7 节。
+更新至 2026-09-02：后端 116 项回归测试通过；第二阶段 Plugin Command 与 Plugin Settings/Secret 接口已实现，详细 DTO 和边界见《第二阶段接口契约-开发版》第 7 节。
 
 - Chat、Agent Run、Agent Events、Tool 列表、Provider 配置生命周期、模型列表和连接测试已经接入 AI Core。
 - Agent Run/Event 已持久化到 SQLite；SSE 帧携带 sequence `id`，断线后可以回放缺失事件。Trace API 与 Benchmark 共用同一事件事实，并在入库前执行 Secret 脱敏和结果限长。

docs/contracts/第二阶段接口契约-开发版.md

@@ -544,7 +544,9 @@ error
 
 当前宿主只注册已启用且已满足权限授权的 Plugin Command。执行前按 JSON Schema 校验参数、按 `when` 校验上下文，再根据 Command 声明裁剪 Context；单次执行默认超时 30 秒，effect 的 JSON 编码结果不得超过 64 KiB。宿主保留最多 500 条轻量审计事件，仅记录 Command、Plugin、状态、耗时和错误码，不记录 arguments、Context、effect 或 Secret。
 
-需要 Secret 的 Command 必须在 `commands.yaml` 的内部 `secrets` 数组中声明对应 Setting Key，并在 Plugin Manifest 声明 `secrets.use` 权限。安装时宿主校验该字段确实属于当前 Plugin Settings Schema 的 `secret` 类型；只有权限已授予并启用后，运行时才向受控 handler 提供按需 Resolver，未声明字段返回 `PLUGIN_SECRET_ACCESS_DENIED`。`secrets` 不属于前端 `PluginCommand` DTO，Secret 明文也不会并入普通 Settings 字典。
+需要 Secret 的 Command 必须在 `commands.yaml` 的内部 `secrets` 数组中声明对应 Setting Key，并在 Plugin Manifest 声明 `secrets.use` 权限。安装时宿主校验该字段确实属于当前 Plugin Settings Schema 的 `secret` 类型；只有权限已授予并启用后，运行时才向受控 handler 或 MCP Command Target 提供声明过的 Secret。未声明字段返回 `PLUGIN_SECRET_ACCESS_DENIED`，必填 Secret 未配置返回 `PLUGIN_SECRET_REQUIRED`。`secrets` 不属于前端 `PluginCommand` DTO，Secret 明文也不会并入普通 Settings 字典。
+
+`commands.yaml` 中的执行目标必须在宿主白名单 `handler` 与当前 Plugin 命名空间的 `mcp_tool` 之间二选一。MCP Command Target 不注册为 Agent Tool；宿主用 `_notesagent` 保留包装传入 Command ID、参数、裁剪后的 Context 和声明过的 Secret，并将 MCP structured result 再校验为白名单 effect。Command 与 Tool Schema 仅允许 `#...` 文档内引用，任何通过 `$ref` 或 `$dynamicRef` 指向文件、HTTP 或其他外部资源的 Schema 都会在注册前被拒绝。
 
 ### 7.5 Settings Schema
 
@@ -627,7 +629,7 @@ DELETE /api/plugins/{plugin_id}/settings/{key}/secret
 
 Secret 明文不进入普通 Settings、日志、Trace、Benchmark Dataset 或前端持久化。
 
-非敏感值按 `plugin_id` 写入 `APP_DATA_DIR/plugins/settings.json`。该文件只保存普通值、Schema 版本和确定性的 Secret Reference；Secret 本身由宿主凭据存储加密保存。卸载 Plugin 时同时清理它的 Settings 命名空间和 Secret Reference。当前开发阶段使用 Fernet 文件凭据存储，第三阶段接入桌面 Host 后应迁移到 Stronghold 或系统 Keychain。
+非敏感值按 `plugin_id` 写入 `APP_DATA_DIR/plugins/settings.json`。该文件只保存普通值、Schema 版本和确定性的定长 Secret Reference，格式为 `plugin.<sha256(plugin_id\\0setting_key)>`；Secret 本身由宿主凭据存储加密保存。卸载 Plugin 时同时清理它的 Settings 命名空间和 Secret Reference。当前开发阶段使用 Fernet 文件凭据存储，第三阶段接入桌面 Host 后应迁移到 Stronghold 或系统 Keychain。
 
 `plugin.*` 为宿主保留凭据命名空间。`/api/credentials/{credential_id}`、Provider 持久配置、Provider 临时测试凭据和 Provider Resolver 均拒绝该前缀，防止通过 Provider 链路覆盖、删除或向外部 Base URL 发送 Plugin Secret。
 
@@ -657,6 +659,7 @@ PLUGIN_SETTINGS_VERSION_CONFLICT
 PLUGIN_SETTINGS_FIELD_INVALID
 PLUGIN_SECRET_FIELD_NOT_FOUND
 PLUGIN_SECRET_ACCESS_DENIED
+PLUGIN_SECRET_REQUIRED
 PLUGIN_SECRET_VALUE_INVALID
 PLUGIN_SECRET_STORE_ERROR
 PLUGIN_STORAGE_ERROR

docs/development/AI-Core与Agent-Core开发说明.md

@@ -2,7 +2,7 @@
 
 > 本文档用于团队开发和模块联调，记录当前已经落地的核心边界与使用方式。
 
-> 更新日期：2026-09-02。第一阶段 AI Core、Agent Core、Extension Core 和 Model Core 主链路已经完成；第二阶段 Agent Trace 持久化、可恢复 SSE、stdio MCP Bridge、隔离 Plugin Host 以及 Plugin Command/Settings 已落地，后端当前回归基线为 107 项测试通过。
+> 更新日期：2026-09-02。第一阶段 AI Core、Agent Core、Extension Core 和 Model Core 主链路已经完成；第二阶段 Agent Trace 持久化、可恢复 SSE、stdio MCP Bridge、隔离 Plugin Host 以及 Plugin Command/Settings 已落地，后端当前回归基线为 116 项测试通过。
 
 ## 当前实现
 

docs/development/Knowledge与Retrieval-Core开发说明.md

@@ -3,7 +3,7 @@
 > 本文档用于团队开发和模块联调，记录 Knowledge Core / Retrieval Core 已经落地的
 > 模块边界、数据模型、接口与使用方式，对应分工表中的杨星萱。
 
-> 更新日期：2026-09-02。第一阶段 Knowledge/Retrieval 主链路已经完成，并已接入 Agent Tool Registry；完整后端回归基线为 107 项测试通过。
+> 更新日期：2026-09-02。第一阶段 Knowledge/Retrieval 主链路已经完成，并已接入 Agent Tool Registry；完整后端回归基线为 116 项测试通过。
 
 ## 当前实现
 

docs/development/MCP-Bridge与Plugin-Host开发说明.md

@@ -235,6 +235,7 @@ backend/extensions/fixtures/mcp-echo
 - `mcp-fixture.large`：验证结果大小上限；
 - `mcp-fixture.environment`：验证宿主 Secret/路径没有进入子进程；
 - `mcp-fixture.exit`：验证异常退出、Tool 注销和 Restart。
+- `mcp-fixture.command`：作为 Plugin Command 专用 MCP Target，验证 Context 裁剪、Secret 传递和与 Agent Tool 的隔离。
 
 Fixture 的 `tools/list` 使用两页响应，用于覆盖分页发现。测试还会启动缺少 tools capability、返回无效 Schema/initialize result，以及输出超长无换行 stdout 的变体。
 

docs/development/Plugin-Command与Settings开发说明.md

@@ -1,6 +1,6 @@
 # Plugin Command 与 Settings 开发说明
 
-> 更新日期：2026-09-02。本文记录第二阶段阶段 D 已实现的 Plugin Command Contribution、Plugin Settings Contribution、Secret 边界和前端 Service Contract。当前回归基线为后端 107 项测试、前端 29 项测试，TypeScript 类型检查和生产构建通过。
+> 更新日期：2026-09-02。本文记录第二阶段阶段 D 已实现的 Plugin Command Contribution、Plugin Settings Contribution、Secret 边界和前端 Service Contract。当前回归基线为后端 116 项测试、前端 29 项测试，TypeScript 类型检查和生产构建通过。
 
 ## 1. 阶段目标
 
@@ -21,7 +21,8 @@ Plugin 在 `plugin.yaml` 的 `contributes.commands` 与 `contributes.settings_se
 - `command_id`、标题、描述、宿主图标；
 - `locations`：`command_palette`、`context_menu` 或 `toolbar`；
 - `when` 与允许传入执行器的 Context 字段；
-- 参数 JSON Schema、可选权限、受控 handler 和超时。
+- 参数 JSON Schema、可选权限、执行目标和超时；
+- 执行目标必须在宿主白名单 `handler` 与当前插件命名空间的 `mcp_tool` 之间二选一。
 - 可选 `secrets` 字段：只声明当前 Command 允许按需读取的 Secret Setting Key，不暴露给前端 DTO。
 
 `settings.yaml` 采用递增 `schema_version`，首批字段类型固定为 `string`、`number`、`boolean`、`select`、`secret`。宿主会校验默认值、必填项、数值边界、Select 选项，以及 Secret 不得携带默认明文。
@@ -38,15 +39,17 @@ Plugin 在 `plugin.yaml` 的 `contributes.commands` 与 `contributes.settings_se
 2. 使用 Draft 2020-12 JSON Schema 校验 arguments；
 3. 根据 `when` 检查必要上下文；
 4. 仅向执行器传递声明过的 Context 字段；
-5. 在超时范围内调用宿主受控 handler；
+5. 在超时范围内调用宿主受控 handler，或调用独立的 MCP Command Target；
 6. 校验 effect 类型、可序列化性和 64 KiB 大小上限；
 7. 返回统一 `PluginCommandResult`。
 
 首批 effect 为 `none`、`notification`、`navigate`、`refresh` 和 `job`。前端不得把 effect 当作任意代码执行。
 
-Command 执行器通过受控 Resolver 按需读取 `commands.yaml` 已声明且确实属于当前 Plugin Schema 的 Secret；使用 Secret 的 Plugin 还必须声明并获授 `secrets.use` 权限，读取未声明字段返回 `PLUGIN_SECRET_ACCESS_DENIED`。Secret 不会并入普通 Settings 字典。Command 审计使用 500 条有界内存队列，仅保留 `command_id`、`plugin_id`、成功/失败状态、耗时、错误码和时间。arguments、正文选区、文件路径、effect 与 Secret 均不进入审计事件。
+Command 执行器通过受控 Resolver 按需读取 `commands.yaml` 已声明且确实属于当前 Plugin Schema 的 Secret；使用 Secret 的 Plugin 还必须声明并获授 `secrets.use` 权限。读取未声明字段返回 `PLUGIN_SECRET_ACCESS_DENIED`，必填 Secret 未配置则返回 `PLUGIN_SECRET_REQUIRED`。Secret 不会并入普通 Settings 字典。Command 审计使用 500 条有界内存队列，仅保留 `command_id`、`plugin_id`、成功/失败状态、耗时、错误码和时间。arguments、正文选区、文件路径、effect 与 Secret 均不进入审计事件。
 
-当前声明式宿主提供安全白名单 handler，后续如允许 MCP Server 承担 Command 逻辑，应增加独立的 MCP Command Target Contract，不能把插件给出的模块路径或 Shell 字符串直接执行。
+MCP Command Target 是专用执行目标，不注册进 Agent `ToolRegistry`，因此模型无法绕过 Command 权限与 Context 裁剪直接调用。宿主通过 `_notesagent` 保留包装传入 `command_id`、已校验 arguments、已裁剪 Context 和声明过的 Secret；MCP Server 必须返回结构化的白名单 effect。远程原始错误不直接透传给 HTTP 调用方。插件仍不能把模块路径或 Shell 字符串作为执行器。
+
+Command 与 Tool 的 JSON Schema 只允许当前文档内的 Fragment 引用（`#...`）；宿主在注册前递归拒绝 `$ref` / `$dynamicRef` 指向的文件、HTTP 或其他外部资源，避免 Schema 校验触发未授权 I/O。
 
 ## 4. Settings 与 Secret 边界
 
@@ -60,7 +63,7 @@ APP_DATA_DIR/plugins/settings.json
 
 - 当前 Schema 版本；
 - 非敏感字段值；
-- Secret 的确定性引用，例如 `plugin.text-tools.api_key`。
+- Secret 的确定性定长引用，格式为 `plugin.<sha256(plugin_id\\0setting_key)>`。
 
 Secret 写入必须调用专用端点。后端通过 `SecretStr` 接收明文，再交给现有 `EncryptedCredentialStore`；普通 Settings API 只返回 `{ configured: true|false }`，不会返回 Secret 值。`plugin.*` 是保留命名空间，通用凭据 API、Provider 配置、Provider 临时测试凭据和 Provider Resolver 均不得访问，防止覆盖、删除或外发 Plugin Secret。卸载 Plugin 时同时删除普通设置命名空间和对应加密凭据。
 
@@ -103,6 +106,6 @@ pnpm type-check
 pnpm build
 ```
 
-阶段 D 测试覆盖注册/注销生命周期、位置过滤、参数与 Context 校验、上下文裁剪、设置影响命令执行、声明式 Secret Resolver 与越权拒绝、Provider/通用凭据命名空间隔离、五类设置字段、Schema 版本冲突、Secret 密文与清理、损坏存储、空 Command 列表等无效贡献文件、OpenAPI 路径和前端 Service 请求格式。
+阶段 D 测试覆盖注册/注销生命周期、位置过滤、参数与 Context 校验、上下文裁剪、设置影响命令执行、声明式 Secret Resolver 与越权拒绝、真实 MCP Command Target 与 Agent Tool 隔离、必填 Secret 传递、外部 Schema 引用拒绝、定长 Secret Reference、Provider/通用凭据命名空间隔离、五类设置字段、Schema 版本冲突、Secret 密文与清理、损坏存储、空 Command 列表等无效贡献文件、OpenAPI 路径和前端 Service 请求格式。
 
 生产构建仍会报告现有大 Chunk 警告，不影响构建成功；该问题属于前端按路由和 Markdown 依赖拆包的后续性能任务。

docs/development/前端壳子与接口层开发说明.md

@@ -187,12 +187,12 @@ pnpm build
 ```text
 pnpm build       passed
 pnpm test        29 passed
-uv run pytest    107 passed
+uv run pytest    116 passed
 preview smoke    HTTP 200
 git diff --check passed
 ```
 
-当前前端使用 Vitest 执行 Store、Workspace API Adapter、SSE 恢复游标、Plugin Command/Settings Service、文件树、编辑器组件、智能体标签、轻量动效约束、Markdown 对比度 Token、scoped CSS 选择器约束和 Shiki GitHub 双主题测试；`pnpm build` 同时执行 `vue-tsc -b` 与 Vite 生产构建。后端测试出现过 `.pytest_cache` 无法写入的 Windows 权限警告，不影响 107 项测试结果，也不涉及产品代码。
+当前前端使用 Vitest 执行 Store、Workspace API Adapter、SSE 恢复游标、Plugin Command/Settings Service、文件树、编辑器组件、智能体标签、轻量动效约束、Markdown 对比度 Token、scoped CSS 选择器约束和 Shiki GitHub 双主题测试；`pnpm build` 同时执行 `vue-tsc -b` 与 Vite 生产构建。后端测试出现过 `.pytest_cache` 无法写入的 Windows 权限警告，不影响 116 项测试结果，也不涉及产品代码。
 
 Vite 当前会提示 Chat 与 Workspace 的部分异步 Chunk 超过 500 kB，这是 Milkdown、CodeMirror、KaTeX 和 Shiki 等编辑/渲染依赖带来的性能优化项，不影响构建成功或功能正确性；进入桌面打包前应通过手动分包或更细粒度动态加载继续优化。
 

docs/development/模型提供商与模型发现开发说明.md

@@ -104,4 +104,4 @@ pnpm build
 
 自动化验证覆盖 Provider 预设、OpenAI-Compatible `/models` 请求与鉴权头、模型映射、前端自动刷新、排序去重及按 Provider 隔离错误。生产构建同时执行 Vue 和 TypeScript 类型检查。
 
-当前完整回归基线：后端 107 项测试、前端 29 项测试通过，前端类型检查和生产构建通过。Provider 配置目前仍保存在内存 Registry，AI Core 重启后需要重新创建；凭据密文会保留。`plugin.*` 为 Plugin Secret 保留命名空间，Provider 配置、临时测试凭据和通用凭据 API 均拒绝该前缀。OpenAI Responses 与 Anthropic Messages Adapter 尚未实现，设置页正式预设不会使用这两种协议。
+当前完整回归基线：后端 116 项测试、前端 29 项测试通过，前端类型检查和生产构建通过。Provider 配置目前仍保存在内存 Registry，AI Core 重启后需要重新创建；凭据密文会保留。`plugin.*` 为 Plugin Secret 保留命名空间，Provider 配置、临时测试凭据和通用凭据 API 均拒绝该前缀。OpenAI Responses 与 Anthropic Messages Adapter 尚未实现，设置页正式预设不会使用这两种协议。

docs/retrospectives/后端全面审阅问题与修复复盘.md

@@ -4,7 +4,7 @@
 > 审阅范围：FastAPI、Knowledge / Retrieval Core、Agent Core、Extension Core、Provider Adapter、公共接口和后端开发文档。
 > 文档用途：记录问题形成原因、实际影响、修复判断和落地方案，供后续开发文档、比赛材料与技术博客使用。
 
-> 2026-09-02 状态补充：本文记录的缺陷均保持修复。此后又加入 Provider 预设、模型发现、DeepSeek/OpenAI 凭据解析、Fernet 加密存储、Agent Trace 持久化、stdio MCP Plugin Host 和 Plugin Command/Settings，当前完整后端回归基线为 107 项测试通过。
+> 2026-09-02 状态补充：本文记录的缺陷均保持修复。此后又加入 Provider 预设、模型发现、DeepSeek/OpenAI 凭据解析、Fernet 加密存储、Agent Trace 持久化、stdio MCP Plugin Host 和 Plugin Command/Settings，当前完整后端回归基线为 116 项测试通过。
 
 ## 1. 审阅结论